Resumo da 2ª temporada de «Lioness»: tudo o que você precisa saber

O violento sequestro da congressista força o Secretário de Estado, Edwin Mullins, a autorizar uma operação de emergência em território mexicano. A Equipe de Resposta Rápida liderada por Joe cruza a fronteira, resultando em um confronto sangrento contra pistoleiros do cartel e policiais mexicanos corruptos. Pouco depois, a equipe age a partir de uma pista do agente do DEA, Gutierrez, sobre um galpão do cartel onde supostamente seriam guardadas armas e drogas. No entanto, a operação revela uma rede de tráfico humano: em vez de remessas ilícitas, os agentes encontram centenas de crianças e jovens no local. Sem capacidade logística para resgatá-los, a equipe recua, mas Joe esconde estrategicamente um rastreador no sapato de uma garota.

Posteriormente, agindo contra as ordens diretas de seus superiores, Joe convence Gutierrez a iniciar uma interceptação do comboio sob a jurisdição do DEA. Junto com parte de sua equipe, Joe se junta à missão sob a fachada de "consultora". O confronto na fronteira termina em tragédia: um ataque de drone do cartel mata vários agentes do DEA, um homem-bomba se explode junto a um grupo de crianças e a própria Joe fica gravemente ferida.

Paralelamente, Joe recruta uma nova operativa: Josephina "Josie" Carrillo, capitão da Aviação do Exército e piloto de helicópteros Apache. Josie é sobrinha de Alvaro Carrillo (líder do cartel "Los Tigres") e filha de Pablo Carrillo, um advogado de imigração americano secretamente conectado ao irmão narcotraficante. O plano da CIA consiste em simular a expulsão desonrosa de Josie das forças armadas para forçá-la a voltar para o pai e, eventualmente, entrar para a organização do tio como piloto. Para treinar a nova recruta sem experiência de campo, Joe convoca a ex-Lioness Cruz Manuelos, que havia retornado ao serviço ativo nos Fuzileiros Navais. No entanto, a operação apresenta falhas desde o início: durante o treinamento, descobre-se que Josie escondeu seu domínio do espanhol e mentiu sobre a frequência dos contatos com a família, destruindo a confiança de Joe.

Conforme a investigação avança, a CIA descobre que a inteligência chinesa está usando as rotas do cartel para o transporte clandestino de físicos nucleares, transformando uma ameaça regional em uma crise internacional. A agência abandona a estratégia de infiltração de longo prazo e lança a Operação "Sky Hawk" para eliminar os cientistas na fronteira entre a Turquia e o Irã. Como a missão exige um ataque aéreo de alta precisão contra o comboio, a CIA decide aproveitar as habilidades de Josie como piloto militar.

Enquanto isso, Kaitlyn Meade articula nas altas esferas do poder em Washington. Trabalhando ao lado do Secretário Mullins e da Chefe de Gabinete da Casa Branca, Mason, Kaitlyn busca apoio político para autorizar ataques transfronteiriços, ao mesmo tempo em que tenta evitar o colapso emocional e operacional de Joe.

O final da temporada se desenrola no terreno hostil da fronteira entre o Irã e a Turquia. Josie assume o comando do helicóptero de ataque enquanto Cruz opera a metralhadora lateral para interceptar o comboio. A missão se transforma em um massacre quando o fogo inimigo derruba a aeronave, deixando a unidade encurralada por forças da Guarda Revolucionária Islâmica (IRGC). Joe e a Equipe de Resposta Rápida travam um combate desesperado para resgatar os sobreviventes, escapando da aniquilação total momentos antes da chegada do apoio aéreo.

Simultaneamente, Byron e Kaitlyn fecham um acordo secreto com Pablo Carrillo, que a equipe de Joe mantinha sob custódia. Eles o forçam a marcar um encontro com seu irmão Alvaro e a executá-lo pessoalmente, instalando Pablo como o novo líder dos "Los Tigres" sob o controle da CIA.